許多藥物可抑制營養物質的攝取。如治療兒童多動症的利他林、苯丙胺，可使兒童食慾不振而致營養攝入不足。
抗腫瘤藥氮芥類、亞硝脲類可引起患者嚴重的噁心、嘔吐、厭食等不良反應。
有些藥物，如酚酞、石蠟油等瀉劑，可使腸蠕動增強，腸內食物排空加快，不利於營養物質的消化吸收，尤其是對脂溶性物質如脂肪和維生類A、D、K等的吸收。消膽胺也會妨礙此類營養物質的吸收。
有些藥物干擾體內營養物質的生物合成和利用而引起營養不良。如長期服用碘胺藥、四環素、氯黴素的患者，可因腸道內正常菌羣受抑制，影響維生素K的生物合成而導致維生素K缺乏。長期服用糖皮質激素可引起蛋白質合成下降，促使蛋白質轉變成糖元，減少組織對葡萄糖的利用和腎小管對葡萄糖的重吸收。
藥物還可影響營養在人體內的貯存。如四環素、阿司匹林及巴比妥類藥物可增加維生素C在尿中的排泄。硼酸可把血漿中的維生素B置換出來，並增加其排泄量。苯巴比妥、苯妥英鈉、撲癲酮等可加速維生素D的分解。
防治藥物引起的營養不良是一個值得重視的問題。
首先，應合理地選用藥物，儘可能地避免長期、大劑量地單獨使用這類藥物。
其次，用藥後出現與原發疾病無關、與服用藥物的不良反應也無關的營養缺乏症狀時，應考慮停藥，或改用其它藥物。
必要時可用小劑量皮質激素增進食慾，補充營養液、能量合劑等，以控制或糾正藥物所致的營養不良。
