配製藥酒看似簡單，其實需要一定的專業知識，如果對藥性不清楚、不瞭解配製常識，可能會發生意外，因此一定要注意安全，避免毒副作用。
那些僅流傳於民間的偏方，未經過長期臨牀應用的檢驗，其安全性和有效性都會大打折扣，不能盲目採用。一定要弄清楚其中的主要藥物成分、適應症和禁忌症，要防止因同名異物或異名同物而搞錯藥材。
大家在選擇藥材時，常見誤區如下
第一，藥材不分生熟。某些藥材的鮮藥和生藥在服用前，往往需要先行加工炮製。比如川烏、草烏都是祛風溼、散寒止痛的良藥，但生品含有烏頭鹼，0.2毫克就能中毒，3—5毫克即會達致死量。而且，因爲藥物在酒中的溶出率會增加，所以在藥酒中其毒性會愈加明顯，我們就曾遇到過因服用自己配製的生川烏、生草烏藥酒而致命的悲劇。
第二，望詞生義，用錯藥材。例如，有人不懂藥理藥性，誤認爲止咳平喘的華山參也是人蔘類的補益藥，泡酒服用出現了面部潮熱、手舞足蹈的阿托品中毒症狀。
第三，同物異名，忽視藥材的正規名稱。例如，有人因爲不會鑑別中藥材，把有“野天麻”之稱的曼陀羅當成天麻，大劑量使用製成藥酒而致中毒。曼陀羅含有東莨菪鹼，過量服用會引起神經系統損害，甚至死亡。
我國現存最早的本草專著——《神農本草經》指出“藥性有宜酒漬者，亦有不可入湯酒者，不得違越”。說明有些藥物是不宜入酒的，大家應該在醫生的指導下配製藥酒，以免懵懂中飲下自釀的“苦酒”。
