1、生殖道感染较为常见。近年来随着性传播疾病发病率的提高，生殖道炎症如前列腺炎、睾丸炎、附睾炎、尿道炎的发病率和严重程度有所增加，严重影响男性的生育能力。
2、内分泌疾病。原因是促性腺激素缺乏。常见的有选择性促性腺功能低下型性机能减退，即Kallmann氏综合征；选择性LH缺陷症和FSH缺陷症；肾上腺皮质增生症；高泌乳素血症等。
3、输精管道梗阻。影响精子的输送。
4、染色体异常。常见的有男性假两性畸形、克氏综合征和XYY综合征。
5、男性性功能障碍。阳痿、早泄、不射精和逆行射精皆可引起男性不育。
6、睾丸生精功能异常。
a、常见于隐睾，精索静脉曲张，毒素、磁场、高热和外伤等理化因素皆可引起睾丸的生精障碍。
b、鞘膜积液：鞘膜积液压迫了睾丸血液循环，可导致睾丸感染或萎缩。该病青春期后发病率为16%—19%。
c、睾丸后天损伤：如疝气修补术、鞘膜积液手术、睾丸固定手术等损伤了睾丸血管，阻碍血供而使睾丸萎缩。
7、精子结构异常和精浆异常。影响精子的运动、获能和顶体反应等。
8、免疫性不育。男性自身产生的抗精子免疫和女性产生的抗精子同种免疫均可引起男性不育。
正常的精子可引起精子自身免疫的因素有：
a、睾丸外伤或外科手术。
b、输出管道(如附睾、输精管)梗阻。
c、老年时睾丸退行性变。
d、睾丸和附属性腺(特别是前列腺和精囊)的感染。
这引起因素均可引起精子抗体与自身免疫系统接触，T细胞致敏和产生睾丸炎。对精子抗原的自体免疫或同种免疫，至少有两种机制引起不育：
a、干扰发生过程，引起无精症或少精症。
b、通过抗体对精子在正常生育有中的作用产生不育影响。
