乙肝病毒進入人體後，迅速進入肝細胞內，並在肝細胞內複製產生新的病毒。新的病毒又進入其他肝細胞。使其受到感染，這樣周而復始，使大量肝細胞受到感染。
乙肝病毒複製過程中會產生許多病毒蛋白抗原，包括表面抗原(HBsAg)、e抗原(HBeAg)、核心抗原(HBcAg)等，這些抗原刺激人體免疫系統產生相對應抗體即表面體(抗一HBs)、e抗體(抗一HBe)。核心抗體(抗一HBc)等。其中HBsAg，HBeAg，抗一HBc同時陽性稱之爲“大三陽”。HBsAg，抗一HBe，抗一HBc陽性稱之爲“小三陽”。它們都是乙肝病毒感染的標誌。>
一般來講，“大三陽”者體內病毒要多一些，傳染性要強一些。肝內可能有活動性炎症;“小三陽”者體內病毒要少一些，傳染性小一些，肝內炎症要輕一些。但肝硬化、肝癌患者乙肝病毒指標常常爲“小三陽”，因此，“小三陽”不都意味着病情一定就輕一些。“大、小三陽”者可能是肝炎、肝硬化患者，也可能是病毒攜帶者。肝炎、肝硬化患者必須接受抗病毒等治療，以阻止病情向前發展。>
那麼，乙肝病毒攜帶者需不需要治療呢?根據肝臟穿刺組織學觀察發現，大部分乙肝病毒攜帶者肝臟有不同程度損傷，只有15%左右乙肝病毒攜帶者肝臟組織學檢查是正常的，有50%左右攜帶者已經發展爲慢性肝炎、肝硬化。>
對乙肝病毒感染者長期隨訪觀察發現，血液中乙肝病毒量越大，攜帶時間越長，發展成肝硬化、肝癌的機會越大。因此，儘早清除乙肝病毒或者控制血液乙肝病毒量，十分必要。
