急性腎盂腎炎發病較急，常令患者不知所措。這時及時進行急性腎盂腎炎的治療很重要，因爲越早治療，越能控制病情的發展，而不至於發展嚴重。患者應多飲水、勤排尿，以降低髓質滲透壓，再配以藥物治療，儘早恢復健康。
（一）一般治療
目的在於緩解症狀，防止復發，減少腎實質的損害。應鼓勵患者多飲水，勤排尿，以降低髓質滲透壓，提高機體吞噬細胞功能，沖洗掉膀胱內的細胞。
通常應鼓勵患者多飲水、勤排尿，以降低髓質滲透壓，提高機體吞噬細胞功能。有發熱等全身感染症狀應臥牀休息。服用碳酸氫鈉1g，每日3次，可鹼化尿液，減輕膀胱刺激刺激症狀，並對氨基糖甙類抗生素、青黴素、紅黴素及磺胺等有增強療效作用，但可使四環素、呋喃咀啶的藥效下降。有誘發因素者應治療，如腎結石、輸尿管畸形等。抗感染治療最好在尿細菌培養及藥物敏感試驗下進行。
（二）抗感染治療
1.急性腎盂腎炎 因引起尿路感染的主要細菌是革蘭陰性菌，其中以大腸桿菌爲主。初發的急性腎盂明炎可選用複方磺胺甲惡唑（SMZ-TMP）2片，日2次，或吡哌酸0.5g，日3~4次，諾氟沙星0.2g，日3次，療程7~14天。感染嚴重有敗血症者宜靜脈給藥。根據尿培養結果選用敏感藥物。如頭孢哌酮，阿米卡星毒素對葡萄球菌、克雷伯菌、變形桿菌，綠膿桿菌、大腸桿菌的敏感率均在90%以上。前者1~2g，每8~12小時1次，後者0.4g，每8~12小時1次。氟喹諾酮類藥物對變形桿菌、枸櫞酸桿菌及克雷伯菌敏感率在80%以上。哌拉西林、氨苄西林、呋啁妥因對D羣腸球菌100%敏感。用法，前2者1~2，每6時1次；後者0.1g，日3次。真菌感染用酮康唑0.2g，日3次。或氟康唑50mg，日2次。
新生兒，嬰兒和5歲以下的幼兒急性腎盂腎炎多數伴有泌尿道畸形和功能障礙，故不易根除，但有些功能障礙如膀胱輸尿管返流可隨年齡增長而消失。一次性或多次尿感在腎組織中形成局竈性疤痕，甚至影響腎發育，近年來主張用藥前儘可能先做中段尿細胞培養，停藥後第2、4、6周應複查尿培養，以期及時發現和處理。
2.慢性腎盂腎炎 急性發作者按急性腎盂腎炎治療，反覆發作作者應通過尿細菌培養並確定菌型，明確此次再發是復發或重新感染。
復發：指治療後菌株轉陰性，但在停藥後的6周內再發，且致病菌和先前感染的完全相同。復發的常見原因有①尿路解剖上或功能上異常，引起尿流不暢。可通過靜脈腎盂造影或逆行腎盂造影以明確之，如有明顯解剖異常情況存在，需手術加以糾正。如果梗阻因素難以解除，則根據藥敏選用恰當抗菌藥治療6周。②抗菌藥選用不當或劑量和療程不足，常易復發，可按藥敏選擇用藥，治療4周。③由於病變部位瘢痕形成，血流量差，病竈內抗菌藥濃度不足，可試用較大劑量殺菌類型抗菌藥治療如先鋒黴素、氨苄青黴素、羥苄青黴素、乙基因梭黴素等，療程6周。
一年內如尿感發作在3次或3次以上的者又稱複發性尿感，可考慮長程低劑量治療。一般選毒性低的抗菌藥物，如複方磺胺甲噁唑或呋喃坦丁每晚一粒，服用1年或更長，約605患者菌尿轉陰。男性因前列腺炎引起復發者，宜同時治療慢性前列朱炎，選用脂溶性抗菌藥物如複方磺胺甲噁唑；環內沙星0.5g，日2次；利福平0.45~0.6g，頓服，療程宜長達3月。必要時手術切除病變（增生、腫瘤）這前列腺。
如果經兩個療程的足量抗菌治療後，尿菌仍持續陽性，可考慮長程低劑量治療。一般採用複方新諾明或呋喃叮每晚一次，可以服用1年或更長，約60%患者菌轉陰。
再感染：指菌尿轉陰後，另一種與先前不同的致病菌侵入尿路引起的感染，一般在菌尿轉陰6周後再發。婦女的尿感再發，85%是重新感染，可按首次發作的治療方法處理，並囑患患者重視尿感的預防。同時應全面檢查，有無易感因素存在，予以去除。
