1、牙痛：三叉神經痛常誤診爲牙痛，往往將健康牙齒拔除，甚至拔除全部牙齒仍無效，故應注意。牙病引起的疼痛爲持續性疼痛，多侷限於齒齦部，局部有牙痛及致病病變，X線及牙科檢查可以確診。
2、偏頭痛：疼痛部位超出三叉神經範圍，發作前多有視覺先兆，如視力模糊、暗點等，可伴嘔吐。疼痛爲持續性，時間長，往往半日至1-2日。
3、副鼻竇炎：如額竇炎、上頜竇炎等，爲侷限性持續性痛，可有發熱、鼻塞、濃涕及局部壓痛等。
4、舌咽神經痛：易於三叉神經第3支痛相混，舌咽神經痛的部位不同，爲軟齶、扁桃體、咽舌壁、舌根及外耳道等處。疼痛由吞嚥動作誘發。用1%潘妥卡因或可卡因等噴咽區後疼痛可消失。
5、青光眼：單側青光眼急性發作誤診爲三叉神經第1支痛，青光眼爲持續性痛，不放射，可有嘔吐，伴有球結合膜充血、前房變淺及眼壓增高等。
6、面部神經痛：多見於青年人，疼痛超出三叉神經範圍，可延及耳後、頭頂、枕頸，甚至肩部等。疼痛持續性，可達數小時，與動作無關，不怕觸摸，可爲雙側性疼痛，夜間可較重。
7、顳頜關節炎：疼痛侷限於顳頜關節腔，呈持續性，關節部位有壓痛，關節運動障礙，疼痛與下頜動作關係密切，可行X線及專科檢查協助診斷。
8、三叉神經炎：病史短，疼痛呈持續性，三叉神經分佈區感覺過敏或減退，可伴有運動障礙，在受累的三叉神經分支有明顯壓痛。神經炎多在感冒或副鼻竇炎後等發病。
