科學家的觀察發現，無論是急性吸菸還是慢性吸菸都可以使胃酸分泌增加。在吸菸開始30分鐘後十二指腸的酸度就開始增高，直到停止吸菸30~60分鐘才能恢復到正常水平。
吸菸可使胃的幽門括約肌鬆弛，導致膽汁反流發生。
吸菸延遲胃的排空，影響胰腺和十二指腸分泌碳酸氫鹽，從而削弱中和胃酸作用。
香菸中的尼古丁直接損傷粘膜的血管，使胃粘膜血流量減少。
吸菸還可以使胃粘膜中的保護性細胞因子分泌減少，這些都使得胃粘膜的屏障保護作用減弱，而導致消化性潰瘍。
