本病臨牀表現輕重不等，全身性鉅細胞包涵體病主要發生於新生兒和幼嬰期，如此時見到黃疸、肝脾腫大、皮膚瘀點、小頭畸形、顱內鈣化等，應注意與弓形體病、敗血症、先天性膽道梗阻、乳兒肝炎、全身性單純皰疹、先天性白血病、先天性風疹綜合徵等鑑別。智力低下，運動障礙、腦性癱瘓等症狀一般在較大嬰兒才能被發現。
兒童期出現下列情況時，要考慮獲得性鉅細胞包涵體病的可能性：①不能以其他病因解釋的慢性肝病或遷延性間質性肺炎;②臨牀類似傳染性單核細胞增多症，但抗EB病毒衣殼抗原的嗜異凝集試驗陰性，往往發生於手術(尤其開心手術)後接受大量新鮮血者;③接受免疫抑制劑治療的慢性消耗性疾病患兒(如白血病、惡性腫瘤)、接受器官移植的受者，如發生較嚴重的肺炎，往往是CMV感染所致。
遇到上述情況時，要進行病毒學和血清學檢測才能明確診斷。
大多CMV感染是不顯性的。感染後的表現多種多樣。有症狀者分爲兩個類型：
1、先天性感染 約10%患兒在出生後有明顯症狀，表現爲肝脾腫大、持續性黃疸、皮膚瘀點、小頭畸形、脈絡膜視網膜炎、智力低下和運動障礙等。上述任何一項表現都可單獨存在，並可伴有生長緩慢、煩躁、有時發熱，體溫自微熱至40℃。但因出生時僅有一小部分患兒有臨牀症狀，故多數不能確定診斷。如生後數月至數年纔出現症狀者，也可表現爲聽力喪失，輕度神經系統症狀及發育障礙，以致影響學習。先天性鉅細胞包涵體病患兒，可出現各種先天畸形，可有痙攣狀態、兩側癱瘓、癲癇樣抽搐、視神經萎縮、耳聾(約10%患兒發生耳聾)，並可對細菌感染的敏感性增加。有的無症狀先天性CMV感染的患兒，雖體格發育正常，仍可有先天畸形及聽力損害，但其發生率和嚴重程度均低於有症狀的患兒。
2、獲得性感染 本病爲自限性疾病，臨牀表現一般較輕，雖然多數嬰兒爲亞臨牀感染，但其症狀的發生率仍較成人爲高，表現爲肝、脾和淋巴結腫大、皮疹、支氣管炎或肺炎等，也可出現肝炎。與先天性感染患兒不同者爲神經系統極少被侵犯。兒童期感染常通過呼吸道獲得，常爲不顯性，但成爲長期帶毒者，偶可出現遷延性肝炎或間質性肺炎。多次接受新鮮血液輸血的患兒，也可發生此病，其表現可酷似傳染性單核細胞增多症，但EB病毒衣殼抗原的嗜異凝集反應和IgM抗體始終陰性，也可引起溶血性貧血或感染性末梢神經炎。不顯性CMV感染的激活常發生於各種因素使機體免疫力降低的情況下，可使潛在的病毒感染被激活而發病。這些因素包括妊娠、器官移植，應用免疫抑制劑或抗代謝藥物、外科手術、巨血病、腫瘤等，可出現肺炎、肝炎視網膜炎醫學教.育網蒐集整理。間質性肺炎是骨髓移植受者CMV感染最嚴重的後果，其發生率達40%，病死率達90%患兒具有較高的CMV感染率，其特點是遷延的病毒血症，病情呈進行性發展，常爲最常見的死因。
