目前，有不少人對褪黑素的應用存在誤區，把它看成了一種萬能補品，隨便濫用。甚至還有人把它當作禮品送給“坐月子”的產婦補身體。衛生部對這類產品的批文認爲，褪黑素在中年以後隨着年齡的增長在體內的含量愈來愈少，適時補充可以調整人體生物節律，改善睡眠狀況。但適宜人羣爲中老年人;不適宜青少年、孕婦及哺乳期婦女、自身免疫性疾病患者及抑鬱型精神病患者。
有關專家認爲，這類製劑只能改善睡眠和潤腸通便，而沒有延緩衰老、改善性功能、提高免疫力、美容等衆多功效，兒童、孕婦、乳母均不宜服用。患有自身免疫性疾病，如風溼和類風溼關節炎、紅斑狼瘡、某些腎炎者不宜服用，患有抑鬱型精神病，如老年抑鬱症者也不宜服用。目前衛生部除肯定了褪黑素有改善睡眠的作用外，其餘保健作用均未認可。
另有醫學研究證明，如果過多服用褪黑素，可能會導致人體內的甲狀腺素、腎上腺素的濃度相對降低。而這兩種物質是促使細胞積極工作的激素，一旦減少，細胞就會“偷懶”，變得不活躍，使人因疲倦欲睡。此時開車往往容易注意力分散，反應力減弱，敏感度降低，從而導致交通事故的發生。因此，駕車、機械作業及從事危險操作者均應慎用。
美國一家研究機構研究證明，健康的老年人和年輕人一樣，體內可產生同樣水平的褪黑素，因此，健康老年人也不應隨便亂服褪黑素。還有研究認爲，服用高劑量褪黑素有增加中風的危險。因此，除睡眠較差的中老年人可適當試服這類製劑外，健康老人及其他人羣切記不要濫用。
