非甾體抗炎藥爲治療強直性脊柱炎的首選藥，可用於整個病程的治療。瞭解藥物的不良反應，便於及時發現、及時處理。
1.胃腸道不良反應：爲大部分患者首先出現的不良反應，包括噁心、嘔吐、上腹不適或隱痛、飽脹感、噯氣（俗稱打飽嗝）、食慾減退等消化不良症狀，一般症狀都較輕，停藥後可自行緩解。若長期服用此類藥物，部分患者可出現胃、十二指腸潰瘍等消化道潰瘍，嚴重時可伴有消化道出血或穿孔。
2.神經系統不良反應：此類不良反應較常見，包括頭痛、頭暈、耳鳴、暫時性耳聾、弱視、失眠、嗜睡、感覺異常等。有些症狀並不多見，如興奮、幻視、震顫等，其發生率較低。
3.泌尿系統不良反應：部分患者尿中可見紅細胞、白細胞等，出現管型尿、蛋白尿。長期服用此類藥，會增加患者出現腎病的機率，嚴重時可引起間質性腎炎。此類不良反應不常見，可出現於部分患者。
4.過敏反應：易過敏的患者在服藥過程中，可出現皮疹、哮喘等過敏反應。
血液系統不良反應：長期服用此藥，部分患者會出現粒細胞減少、再生障礙性貧血、凝血障礙等表現。
5.妊娠期不良反應：孕婦服用阿司匹林會導致出血，服用吲哚美辛會導致胎兒發育不全或出現畸形。
