香蕉對身體雖有很多好處，但其含有的維生素及礦物質並不齊全，若長期以減肥爲目的將香蕉當成正餐主食，必將導致營養失衡，甚至患上貧血或其他疾病。另外，香蕉含有大量的鎂元素，若空腹食用，會使血液中的含鎂量驟然升高，造成血液中鎂與鈣的比例失調，從而對心血管產生抑制作用。如果再空腹吃香蕉，會因胃腸道蠕動加快，心臟負荷增加，而引發心肌梗塞，長期空腹食用香蕉對胃酸分泌也不利，會加重腸胃病和潰瘍病的病情。同時，香蕉還含有鞣酸，長期空腹吃還容易引起胃結石。在食物性味裏面香蕉屬於寒性食物，對於胃寒腹瀉的患者還是不吃爲妙。
