個別食道癌患者症狀不太明顯，一般食道癌患者的症狀則比較明顯，有噎食倒食、黏痰不斷、入食即吐、反流食、吞吐困難、病竈反射性疼痛明顯症狀，細分則表示爲以下症狀：吞嚥食物時老覺得咽不下去、病竈反射性疼痛、食道老是覺得有東西存在、咽喉發乾：、咽食物好像老是存在食道內，飲水也有相同感覺。
賁門癌與食道癌的症狀十分相似，有時甚至不易區分。早期賁門癌的表現往往是上腹部和胃部的不適、微痛、灼熱感，常有消化不良和食慾減退，這些症狀往往間歇出現，可逐漸加重或轉化。一般賁門癌患者的症狀比較明顯，表現爲噎食倒食、黏痰不斷、入食即吐、反流食、吞吐困難、病竈反射性疼痛。吞嚥困難出現較晚，其程度遠比食道癌輕，發展較緩慢，有些病人直到病程晚期也無嚴重吞嚥困難。局部出血也是賁門癌很常見的症狀。上腹部和背部的持續性鈍痛也是賁門癌晚期的常見症狀。有個別賁門癌患者症狀不太明顯。
正確的賁門癌定義是發生在胃賁門部，也就是食管胃交界線下約2cm範圍內的腺癌。它是胃癌的特殊類型，應和食管下段癌區分。食道癌與賁門癌的區別還有：
1、 當發現食管下段有腫瘤增大改變時，需將內鏡穿過賁門口觀察賁門，胃底和胃體上部有無病變，若有明顯病變，可診斷爲賁門癌，因爲食管癌及胃體賁門者較少見，而賁門癌侵及食管下段的相當多見。
2、 若見有賁門口狹窄或開放不對稱，多提示爲賁門癌。
